Microbiologie Environnement Digestif Santé
UMR 0454 / UCA
- Adresse :
- INRAE Site de Theix
, INRAE - Clermont Auvergne Rh?ne Alpes
63122 SAINT-GENES-CHAMPANELLE
- Tél :
- 04-73-17-83-08
- Sur Internet :
- www6.ara.inrae.fr/medis/
- Adresse :
- CBRV
TSA 50400
28, Place Henri Dunant
63001 CLERMONT-老虎机游戏
- Tél :
- 04-73-17-83-08
- Sur Internet :
- www6.ara.inrae.fr/medis/
Responsables
- Directeur de laboratoire
- Mickael DESVAUX
- Directrice Adjointe
- Stephanie BLANQUET DIOT
Composition équipe ( effectif total : 62 )
- BEYSSAC Erick -
- BLANQUET DIOT Stephanie -
- DHIFALLAH Imen -
- ETIENNE MESMIN Lucie -
- FOURNIER Elora -
- GARRAIT Ghislain -
- LAINE Emmanuelle -
- PEYRET Pierre -
- BERNALIER DONADILLE Annick -
- DESVAUX Mickael -
- FORANO Evelyne -
- HEBRAUD Michel -
- JUBELIN Gregory -
- LECLERC Marion -
- MOSONI Pascale -
- SAPOUNTZIS Panagiotis -
- TALON Regine -
- DEL HOMME Christophe -
- DENIS Sylvain -
- DUNIERE Lysiane -
- DURAND Frederique -
- FADHLAOUI Khaled -
- LEROY Sabine -
- URIOT Ophelie -
- CHAFSEY Ingrid -
- CHALANCON Sandrine -
- COUTURIER Ingrid -
- DURIF Claude -
- DUTILLOY Stephanie -
- GAUDRON Yoan -
- GUILLOT Laurie -
- TARTIERE Romain -
- ANDANT Carine -
- CACCIA Nelly -
- CISSOIRE Arlette -
- DANIEL Julien -
- DANON Jeanne -
- DE MARTRIN Christophe -
- DELMAS Eve -
- DESCHAMPS Charlotte -
- DHAINAUT Catherine -
- DO COUTO Maria Gloria -
- DURAND Alexandra -
- GARRIVIER Annie -
- GONZALEZ Maxence -
- LALLIER Nathalie -
- LEBBAOUI Yacine -
- MAZAL Carine -
- MILESI Sylvie -
- RADECKI Floriane -
- RICHARD Alexandre -
- ROUSSEAU Valerie -
- BELTRAMO Chloe -
- BOURDERI-CAMBON Arnaud -
- BRON Auriane -
- CHUPIET Cyril -
- FAKIH Ibrahim -
- GUILBAUD Justine -
- LEFEVRE Helene -
- NDIAYE Sokhna-Astou -
- SAFARI Niusha -
- TROIN Ugo -
Thèmes de Recherche
L’Unité MEDiS (Microbiologie Environnement Digestif et Santé ; https://www6.ara.inrae.fr/medis/), est une Unité Mixte de Recherche entre INRAE (Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement) et l'UCA (Université Clermont Auvergne) créée en Janvier 2017. L'UMR454 MEDiS est géographiquement localisée sur deux sites, le site de Theix (Centre de Recherche Clermont-Auvergne-Rh?ne-Alpes, 63122 Saint-Genès Champanelle) et le site Dunant (Faculté de Médecine et de Parapharmacie, 63000 Clermont-Ferrand).
L'Unité MEDiS est organisée en mono-équipe et s'articule autour de quatre axes thématiques de recherche interactifs : (i) Pathogènes Alimentaires Zoonotiques (PAZ), avec l'étude de l'écophysiologie des Escherichia coli pathogènes diarrhéiques (DEC), et plus généralement du colibiome et du microbiome associé, ainsi que de listeria monocytogenes, (ii) Fonctions Métaboliques du Microbiote digestif et Dysbioses (FM2D), en particulier avec l'étude d'intrants positifs ou négatifs comme les polyphénols et les xénobiotiques, dans des situations physiologiques ou pathologiques (syndrome de l'intestin irritable et obésité), (iii) GALéniques INNovantes (GALINN) avec le développement de nouvelles stratégies de vectorisation de probiotiques, de prébiotiques ou de substances actives et (iv) INNOvations et développement de modèles in VITRO (INNOVITRO) avec le développement de systèmes digestifs artificiels ou de systèmes de capture de gènes.
Les recherches de l'Unité portent sur l'étude des interactions des microbiotes alimentaires et digestifs de l'animal et de l'Homme avec leur environnement. L'objectif principal des travaux conduits au sein de l'UMR vise à étudier les inter-relations entre micro-organismes intestinaux et alimentation, facteurs environnementaux et/ou agents pathogènes pouvant conduire à différentes situations physio-pathologiques. Il s'agit également de pouvoir proposer des stratégies innovantes permettant de traiter/prévenir les désordres microbiens impliqués dans les états pathologiques étudiés. Le microbiote est ainsi le point central commun aux différents axes de recherche.
L'Unité dispose d'infrastructures expérimentales performantes avec 4 plateaux techniques ; l'Installation Expérimentale Microbiologie (IEM) INRAE, mettant à disposition une animalerie gnotobiotique, le plateau UCA Partner GALBIOPHARM dédié à l'évaluation biopharmaceutique et galénique de composés actifs, le plateau UCA Partner DIGESTIV de simulation de l'environnement digestif humain et animal, le plateau UCA Partner CAPTURE dédié à la capture de gènes. L'Unité a des liens privilégiés avec des plateformes régionales dans lesquelles des scientifiques du MEDiS ont des responsabilités, la plateforme Auvergne Bioinformatique (AuBi), la plateforme d'exploration du métabolisme (PFEM) et la plateforme IRICE PRIMUM (plateforme de recherche intégrative en nutrition et mobilité).
L'UMR MEDiS représente un effectif d'environ 70 personnes dont une quarantaine de titulaires INRAE ou UCA (Directeur de Recheche, Professeur d'Université, Chargé de Recherche, Ma?tre de Conférence Universitaire, Ingénieur de Recherche, Ingénieur d'Etude, Assistant Ingénieur, Technicien de Recherche, Adjoint Technique Principal). Elle accueille régulièrement des doctorants et post-doctorants ainsi que des stagiaires et CDD, représentant en moyenne une quinzaine de contractuels par an. MEDiS accueille et collabore avec des personnels détachés de la société Lallemand, en particulier son Unité d'Affaires Nutrition Animale, avec qui elle développe depuis plus de 25 ans un partenariat de recherche privilégié concernant l'utilisation d'additifs alimentaires pour les animaux d'élevage en lien avec les thèmes FM2D et PAZ.
Publications ( HAL )
- A putative new order of methanogenic Archaea inhabiting the human gut, as revealed by molecular analyses of the mcrA gene
Agnès Mihajlovski , Monique Alric , Jean-Fran?ois Brugère - Gut microbial dysbiosis associated to diarrheic irritable bowel syndrome can be efficiently simulated in the Mucosal ARtificial COLon (M-ARCOL)
Ophélie Uriot , Charlotte Deschamps , Julien Scanzi , Morgane Brun , Nicolas Kerckhove , Christian Dualé , Elora Fournier , Claude Durif , Sylvain Denis , Michel Dapoigny , Philippe Langella , Monique Alric , Lucie Etienne-Mesmin , Blanquet-Diot Stéphanie - Mutational Analysis of Colistin-Resistant Pseudomonas aeruginosa Isolates: From Genomic Background to Antibiotic Resistance
Telma de Sousa , Hsin-Yao Wang , Ting-Wei Lin , Manuela Cani?a , Miguel Ramos , Daniela Santos , Catarina Silva , Sónia Saraiva , Racha Beyrouthy , Richard Bonnet , Michel Hébraud , Gilberto Igrejas , Patrícia Poeta - Microbiota and metabolome dynamics induced by Shiga toxin-producing E. coli in an in vitro model of an infant’s colon
Mariana Izquierdo , Deborah O’sullivan , Ophélie Uriot , Morgane Brun , Claude Durif , Sylvain Denis , Pablo Gallardo , Cormac Gahan , Lucie Etienne-Mesmin , Stéphanie Blanquet-Diot , Mauricio Farfan - Co-Cultivation of Potential Probiotic Strains Isolated from Water Kefir for Fermented Green Tea Beverage
Ameni Abdi , Emna Gatri , Justine Guilbaud , Hassib Bouallagui , Khaled Fadhlaoui , Ghislain Garrait , Lamia Ayed - Kineothrix sedimenti sp. nov., a 3-hydroxybutyrate-producing bacterium isolated from sediment of the meromictic Lake Pavin
Corinne Biderre-Petit , Ayité Adama Hongleda , Ga?lle Marchal , Neha Mehta , Jean-Sébastien Guez , Eric Viollier , Ma?lysia Scheepers , Damien Courtine , Khaled Fadhlaoui - Genomic and functional co-diversification imprint African Hominidae microbiomes to signal dietary and lifestyle adaptations
Saria Otani , Marie Louise Jespersen , Christian Brinch , Frederik Duus M?ller , Bo Pilgaard , Emilie Egholm Bruun Jensen , Pimlapas Leekitcharoenphon , Christina Aaby Svendsen , Amalie Aarestrup , Tolbert Sonda , Teresa Sylvina , Jeff Leach , Alexander Piel , Fiona Stewart , Panagiotis Sapountzis , Paul Kazyoba , Happiness Kumburu , Frank Aarestrup - Necrotizing Enterocolitis in the newborn: a metabolic disturbance revealed by fecal volatolomics useful for diagnosis eight days before first symptoms
jérémy ratel , Ugo Troin , Nathalie Kondjoyan , Frédéric Mercier , Marion Brandolini-Bunlon , Sophie Comtet-Marre , Pierred Peyret , Rochette Chakoory Oshmad , Justine Paysal , Karene Coste , Maguelonne Pons , Etienne Merlin , Erwan Engel - Volatolomics to phenotype Listeria monocytogenes behavior: impact of growth and acid stress
Aya Fakih , jérémy ratel , Dimitra Tsoureki , Frédéric Mercier , Nathalie Kondjoyan , Nelly Caccia , Cristian Botta , Kalliopi Rantsiou , Erwan Engel - Casein structures differently affect postprandial amino acid delivery through their intra-gastric clotting properties
Audrey Boulier , Sylvain Denis , Gwéna?le Henry , Sylvie Guerin , Monique Alric , Nathalie Meunier , Adeline Blot , Bruno Pereira , Corinne Malpuech Brugère , Didier Remond , Yves Boirie , Alain Baniel , Ruddy Richard , Didier Dupont , Ga?lle Boudry
Production scientifique depuis 2021
- Modèle dynamique d'étude in vitro de la perméabilité intestinale d'une molécule d'intérêt couplé en continu à un dispositif de dissolution ou de digestion - 2022
- Procédé de prédiction d'un état ou d'une pathologie - 2023
- Forme galénique à base de pulpe de baobab, procédés de préparation et utilisations - 2021
- Procédé de détection d'une pathologie - 2023
- PROCEDE DE DIAGNOSTIC PREDICTIF D'UNE PATHOLOGIE OU D'UN ETAT PATHOLOGIQUE - 2024