Microbiologie Environnement Digestif Santé

UMR 0454 / UCA
- Adresse :
- INRAE Site de Theix
, INRAE - Clermont Auvergne Rh?ne Alpes
63122 SAINT-GENES-CHAMPANELLE
- Tél :
- 04-73-17-83-08
- Sur Internet :
- www6.ara.inrae.fr/medis/
- Adresse :
- CBRV
TSA 50400
28, Place Henri Dunant
63001 CLERMONT-老虎机游戏
- Tél :
- 04-73-17-83-08
- Sur Internet :
- www6.ara.inrae.fr/medis/
Responsables
- Directeur de laboratoire
- Mickael DESVAUX
- Directrice Adjointe
- Stephanie BLANQUET-DIOT
Composition équipe ( effectif total : 57 )
- ALRIC Monique -
- BEYSSAC Erick -
- BLANQUET-DIOT Stephanie -
- ETIENNE MESMIN Lucie -
- GARRAIT Ghislain -
- LAINE Emmanuelle -
- PEYRET Pierre -
- BERNALIER-DONADILLE Annick -
- DESVAUX Mickael -
- FORANO Evelyne -
- HEBRAUD Michel -
- JUBELIN Gregory -
- MOSONI Pascale -
- SAPOUNTZIS Panagiotis -
- TALON Regine -
- DEL HOMME Christophe -
- DENIS Sylvain -
- DUNIERE Lysiane -
- DURAND Frederique -
- FADHLAOUI Khaled -
- LEROY Sabine -
- MARRE Sophie -
- REUTER Audrey -
- URIOT Ophelie -
- CHAFSEY Ingrid -
- CHALANCON Sandrine -
- COUTURIER Ingrid -
- DURIF Claude -
- GUILLOT Laurie -
- MAZAL Carine -
- RUIZ Philippe -
- CEBALLOS GARZON Carlos Andres -
- ANDANT Carine -
- CACCIA Nelly -
- CISSOIRE Arlette -
- COUDERT Laetitia -
- DANIEL Julien -
- DANON Jeanne -
- DE MARTRIN Christophe -
- DELMAS Eve -
- DHAINAUT Catherine -
- DO COUTO Maria Gloria -
- DURAND Alexandra -
- DUTILLOY Stephanie -
- GARRIVIER Annie -
- LEBBAOUI Yacine -
- MILESI Sylvie -
- RICHARD Alexandre -
- ROUSSEAU Valerie -
- BRON Auriane -
- CHAKOORY Oshma -
- DESCHAMPS Charlotte -
- DESCOTES GENON Pauline -
- FAKIH Ibrahim -
- HERRERA JIMENEZ Marta -
- O'SULLIVAN Deborah -
- DHIFALLAH Imen -
Thèmes de Recherche
L’Unité MEDiS (Microbiologie Environnement Digestif et Santé ; https://www6.ara.inrae.fr/medis/), est une Unité Mixte de Recherche entre INRAE (Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement) et l'UCA (Université Clermont Auvergne) créée en Janvier 2017. L'UMR454 MEDiS est géographiquement localisée sur deux sites, le site de Theix (Centre de Recherche Clermont-Auvergne-Rh?ne-Alpes, 63122 Saint-Genès Champanelle) et le site Dunant (Faculté de Médecine et de Parapharmacie, 63000 Clermont-Ferrand).
L'Unité MEDiS est organisée en mono-équipe et s'articule autour de quatre axes thématiques de recherche interactifs : (i) Pathogènes Alimentaires Zoonotiques (PAZ), avec l'étude de l'écophysiologie des Escherichia coli pathogènes diarrhéiques (DEC), et plus généralement du colibiome et du microbiome associé, ainsi que de listeria monocytogenes, (ii) Fonctions Métaboliques du Microbiote digestif et Dysbioses (FM2D), en particulier avec l'étude d'intrants positifs ou négatifs comme les polyphénols et les xénobiotiques, dans des situations physiologiques ou pathologiques (syndrome de l'intestin irritable et obésité), (iii) GALéniques INNovantes (GALINN) avec le développement de nouvelles stratégies de vectorisation de probiotiques, de prébiotiques ou de substances actives et (iv) INNOvations et développement de modèles in VITRO (INNOVITRO) avec le développement de systèmes digestifs artificiels ou de systèmes de capture de gènes.
Les recherches de l'Unité portent sur l'étude des interactions des microbiotes alimentaires et digestifs de l'animal et de l'Homme avec leur environnement. L'objectif principal des travaux conduits au sein de l'UMR vise à étudier les inter-relations entre micro-organismes intestinaux et alimentation, facteurs environnementaux et/ou agents pathogènes pouvant conduire à différentes situations physio-pathologiques. Il s'agit également de pouvoir proposer des stratégies innovantes permettant de traiter/prévenir les désordres microbiens impliqués dans les états pathologiques étudiés. Le microbiote est ainsi le point central commun aux différents axes de recherche.
L'Unité dispose d'infrastructures expérimentales performantes avec 4 plateaux techniques ; l'Installation Expérimentale Microbiologie (IEM) INRAE, mettant à disposition une animalerie gnotobiotique, le plateau UCA Partner GALBIOPHARM dédié à l'évaluation biopharmaceutique et galénique de composés actifs, le plateau UCA Partner DIGESTIV de simulation de l'environnement digestif humain et animal, le plateau UCA Partner CAPTURE dédié à la capture de gènes. L'Unité a des liens privilégiés avec des plateformes régionales dans lesquelles des scientifiques du MEDiS ont des responsabilités, la plateforme Auvergne Bioinformatique (AuBi), la plateforme d'exploration du métabolisme (PFEM) et la plateforme IRICE PRIMUM (plateforme de recherche intégrative en nutrition et mobilité).
L'UMR MEDiS représente un effectif d'environ 70 personnes dont une quarantaine de titulaires INRAE ou UCA (Directeur de Recheche, Professeur d'Université, Chargé de Recherche, Ma?tre de Conférence Universitaire, Ingénieur de Recherche, Ingénieur d'Etude, Assistant Ingénieur, Technicien de Recherche, Adjoint Technique Principal). Elle accueille régulièrement des doctorants et post-doctorants ainsi que des stagiaires et CDD, représentant en moyenne une quinzaine de contractuels par an. MEDiS accueille et collabore avec des personnels détachés de la société Lallemand, en particulier son Unité d'Affaires Nutrition Animale, avec qui elle développe depuis plus de 25 ans un partenariat de recherche privilégié concernant l'utilisation d'additifs alimentaires pour les animaux d'élevage en lien avec les thèmes FM2D et PAZ.
Publications ( HAL )
- Proteomics and Genetic Approaches Elucidate the Circulation of Low Variability Staphylococcus aureus Strains on Colombian Dairy Farms
Martha Fabiola Rodríguez , Arlen Patricia Gomez , Claudia Marcela Parra-Giraldo , Andres Ceballos-Garzon - Effect of baobab pulp powder on controlled release properties of matrix tablet formulated with whey protein and alginate
Arthur Chervet , Améline Delanne , Ghislain Garrait , Khaled FADHLAOUI , Sandrine Chalancon , Sylvain Denis , Eric Beyssac , Emmanuelle Laine - Study of Antimicrobial Resistance, Biofilm Formation, and Motility of Pseudomonas aeruginosa Derived from Urine Samples
Telma de Sousa , Michel Hébraud , Olimpia Alves , Eliana Costa , Luís Maltez , José Eduardo Pereira , ?ngela Martins , Gilberto Igrejas , Patricia Poeta - The small intestine: dining table of host-microbiota meetings
Karen Delbaere , Inez Roegiers , Auriane Bron , Claude Durif , Tom van de Wiele , Stephanie Blanquet-Diot , Ludovica Marinelli - The Impact of the Virulence of Pseudomonas aeruginosa Isolated from Dogs
Telma de Sousa , Andreia Garcês , Augusto Silva , Ricardo Lopes , Nuno Alegria , Michel Hébraud , Gilberto Igrejas , Patricia Poeta - Transcriptomic and proteomic responses of Microbacterium sp. C448 exposed to sulfamethazine antibiotic
Laurianne Paris , Marion Devers-Lamrani , Muriel Joly , Didier Viala , Marie De Antonio , Bruno Pereira , Nadine Rouard , Pascale Pascale Besse, P. Besse-Hoggan Besse-Hoggan , Michel Hébraud , Fabrice Martin-Laurent , Isabelle Batisson - Microplastics in the human digestive environment: A focus on the potential and challenges facing in vitro gut model development
Elora Fournier , Lucie Etienne-Mesmin , Charlotte Grootaert , Lotte Jelsbak , Kristian Syberg , Stéphanie Blanquet-Diot , Muriel Mercier-Bonin - Fate of microplastics in human digestive in vitro environment and study of the dialogue between epithelium, microbiota and mucus
Elora Fournier - Genome-Wide Analysis of Antigen 43 (Ag43) Variants: New Insights in Their Diversity, Distribution and Prevalence in Bacteria
Valentin Ageorges , Ivan Wawrzyniak , Philippe Ruiz , Cédric Bicep , Mohamed A Zorgani , Jason J Paxman , Bego?a Heras , Ian R Henderson , Sabine Leroy , Xavier Bailly , Panagiotis Sapountzis , Eric Peyretaillade , Micka?l Desvaux - Dietary Live Yeast Supplementation Influence on Cow’s Milk, Teat and Bedding Microbiota in a Grass-Diet Dairy System
Isabelle Verdier-Metz , Céline Delbès , Matthieu Bouchon , Etienne Rifa , Sébastien Theil , Frédérique Chaucheyras-Durand , Eric Chevaux , Lysiane Dunière , Christophe Chassard
Production scientifique depuis 2019
- Forme galénique à base de pulpe de baobab, procédés de préparation et utilisations - 2021
- Modèle dynamique d'étude in vitro de la perméabilité intestinale d'une molécule d'intérêt couplé en continu à un dispositif de dissolution ou de digestion - 2022