Laboratoire de Génétique, Diversité, ?cophysiologie des Céréales
UMR 1095 / UCA
- Adresse :
- Site Crou?l
5, Chemin de Beaulieu
63039 CLERMONT-老虎机游戏
- Tél :
- + 33 4 43 76 15 34
- Sur Internet :
- www6.clermont.inrae.fr/umr1095/
- Adresse :
- Campus Universitaire des Cézeaux
TSA 60026 - CS 60026
1, Impasse Amélie Murat
63178 AUBIERE
- Tél :
- + 33 4 43 76 15 34
- Sur Internet :
- www6.clermont.inrae.fr/umr1095/
Responsables
- Directeur de laboratoire
- Jerome SALSE
- Directeur Adjoint
- Pierre BARRET
- Directeur Adjoint
- Jacques LE GOUIS
- Directrice Adjointe
- Catherine RAVEL
- Gestionnaire d'unité
- Laetitia COUDERT laetitia.coudert@uca.fr
Composition équipe ( effectif total : 91 )
- BONHOMME Ludovic -
- BOUDET Julie -
- CHARRA VASKOU Katline -
- MARLIAC Gaelle -
- MOUZEYAR Said -
- ROCHE EYHERAGUIBEL Jane -
- STEVENS Aurelia -
- ALLARD Vincent -
- BLANCON Justin -
- BOUCHET Sophie -
- CHARMET Gilles -
- CIVAN Peter -
- LE GOUIS Jacques -
- LECARPENTIER Christophe -
- SAINTENAC Cyrille -
- SALSE Jerome -
- SANO Naoto -
- SOURDILLE Pierre -
- BARRET Pierre -
- BEAUVOIR Julien -
- BORJAS ESQUEDA Aldo Daniel -
- BOUGUENNEC Annaig -
- CHOULET Frederic -
- GIROUSSE Christine -
- MARIN Pierre -
- MOREAU Carol -
- OURY Francois Xavier -
- PONCET Charles -
- PONT POULET Caroline -
- RAVEL Catherine -
- STENGER Pierre Louis -
- BANCEL Emmanuelle -
- BERNARD Stephane -
- BRUN Lea -
- CALVAYRAC Catherine -
- CAMBON Florence -
- CARRIAS DELOCHE Marion -
- DEBITON Clement -
- FAYE Annie -
- GAUTIER Veronique -
- GEORGES Ludovic -
- LASSERRE ZUBER Pauline -
- LELOUP Fabien -
- LESSERTEUR Lea -
- MERLINO Marielle -
- NADAUD Isabelle -
- PARTIER Anne -
- PERROCHON Sibille -
- RANOUX Marion -
- RIMBERT Helene -
- TESSERAUD Theophile -
- TIXIER LEYRE Patricia -
- OZTURK Hasret -
- ROCHER Florian -
- ALVAREZ David -
- BARDY Lionel -
- BARGOIN Kevin -
- BENEDIT Stephane -
- BERNARD Nathalie -
- BLANC Richard -
- BOYER Delphine -
- CONFOLENT Carole -
- COUDERT Laetitia -
- DENEFLE Michael -
- DUPUITS Celine -
- GOLEBIEWSKI Julie -
- HUNEAU Cecile -
- JAFFRELO Lydia -
- KITT Jonathan -
- LHOMMET Isabelle -
- MAGNAUDET Julien -
- MARCON Dominique -
- MARTIGNAC Valerie -
- MENECIER Clara -
- PHILIPPE Geraldine -
- ROUGEOL Severine -
- SAUVAT Stephane -
- TASSY Caroline -
- AHCHOUCH Fatima Zahra -
- BACON Antoine -
- DHANASEKARAN Padmapriya -
- FREY Caroline -
- GUACANEME MORENO Martin -
- GUILLOU Clement -
- HAQUET Camille -
- LANGLET Clementine -
- MAGLIARASCHI Ninon -
- MURRELL Kathryn -
- RODRIGUES DE ARAUJO ALVES CRUZ Laila -
- SANGATA Rosie -
- UNVERICHT Marie -
Equipes
- Génétique et Recombinaison (GeCO) , Pierre SOURDILLE
- Centre de Ressources Biologiques (CRB) , Francois BALFOURIER
- Cultures des Plantes en Conditions Contr?lées (CPCC) , Stephane BERNARD
- Diversité et Génomes (DiGen) , Etienne PAUX
- La Variance comme source de Stabilité (VISTA) , Vincent ALLARD
- Maladies des céréales (MDC) , Thierry LANGIN
- Paléogénomique et Evolution (PaléoEvo) , Jerome SALSE
- Plateforme de Bioinformatique (BIOINFO) , Frederic CHOULET
- Plateforme de Transgénèse du Blé (ValFon) , Pierre BARRET
- Plateforme de séquen?age et genotypage (Gentyane) , Charles PONCET
- Qualité des grains (QualiGrain) , Jacques LE GOUIS
Thèmes de Recherche
L’Unité Mixte de Recherche Génétique Diversité Ecophysiologie des Céréales (UMR 1095 GDEC) associe l’INRAE (Départements scientifiques BAP, AgroEnv, SPE, Centre Clermont Auvergne – Rh?ne-Alpes) et l’Université Clermont-Auvergne (UFR de Biologie, Collegium ? Sciences de la Vie, Santé, Environnement ?). Localisée sur le site Inrae de Crou?l (Clermont-Fd) et sur le Campus Universitaire des Cézeaux (Aubière), elle compte 80 permanents (68 Inra, 8 UCA, 3 VAS, 1 CNRS) et 30 à 40 non permanents (Doctorants, Post-Doctorants, CDD, visiteurs). Elle est rattachée à l’Ecole Doctorale 65 Sciences de la Vie, Santé, Agronomie, Environnement, et impliquée dans différentes formations, dont le Master de Biologie Végétale Plant Integrative Biology & Breeding (PIBB) et le Master de Microbiologie.
Les projets, développés au sein de 6 équipes de recherche aux thématiques interconnectées, sont focalisés sur le blé tendre, espèce modèle et d’importance agronomique (2ème céréale au niveau mondial). A l’interface entre recherche fondamentale et recherche finalisée, leur objectif commun est l’amélioration de la qualité et du rendement du blé dans un contexte de transition agroécologique et de changements climatiques, avec comme principaux objectifs : (1) Progresser dans la connaissance de la structure, de l’organisation, du fonctionnement et de l’évolution du génome du blé tendre, comprendre la genèse de nouvelles fonctions et/ou l’évolution de fonctions conservées spécifiques au cours de l’histoire évolutive du blé et plus largement des céréales. (2) Décrypter et modéliser les mécanismes moléculaires et physiologiques impliqués dans le contr?le de caractères agronomiques importants tels que rendement, qualité du grain et résistance/tolérance à des stress biotiques (maladies) ou abiotiques (déficience en azote, en soufre, changements climatiques, …). (3) Analyser et valoriser les ressources génétiques, (4) Contribuer au développement de nouveaux outils et méthodes de sélection (Sélection génomique), et intégrer les connaissances acquises dans des modèles pour améliorer l’efficacité de la sélection variétale. Ces projets s’inscrivent dans les objectifs du Challenge 1 ? Concevoir et piloter des agroécosystèmes durables dans un contexte de changement global ? du projet I-SITE Clermont CAP 20-25.
L’UMR GDEC dispose d’infrastructures expérimentales dotées des équipements les plus récents : Plateforme Stratégique Nationale Gentyane (Séquen?age et génotypage haut débit), Plateforme de Validation Fonctionnelle (transgénèse blés, collections de mutants, Genome Editing), Plateforme de production de matériel végétal en conditions contr?lées (enceintes et chambres climatiques, 1300 m2 de serres conventionnelles, 1000 m2 de serres S2), Centre de Ressources Biologiques Céréales à paille (~27000 accessions), Plateforme de Bioinformatique, Service d’Appui (gestion administrative, financière, RH). Les expérimentations en plein champ sont réalisées en collaboration avec l’Unité Expérimentale INRAE PHACC, l’UMR et l’UE assurant la gestion de la Plateforme de Phénotypage haut débit Pheno3C, qui permet l’étude en condition de plein champ des interactions génotype x environnement, et de tester l’impact de paramètres clefs du changement climatique (stress hydrique, [CO2] atmosphérique).
Considérée aujourd’hui comme un leader incontournable en génomique et génétique des céréales au niveau international, l’UMR GDEC a développé un réseau très dense de collaborations avec des partenaires académiques et privés.
Publications ( HAL )
- Combining wheat with multi-species prairie strips reduces the development of Septoria tritici blotch
Lisa Besson , Olivier Duchene , Ga?l Alvarez , Thomas Becu , Sébastien Fontaine , Nicolas Gross , Magali Joannin , Audrey Niboyet , Stéphane Sauvat , Emma Schwartz , Ga?lle Marliac - [Retracted] Three BUB1 and BUBR1/MAD3-related spindle assembly checkpoint proteins are required for accurate mitosis in Arabidopsis
Laetitia Paganelli , Marie-Cécile Caillaud , Michael Quentin , Isabelle Damiani , Benjamin Govetto , Philippe Lecomte , Pavel A Karpov , Pierre Abad , Marie Edith Chabouté , Bruno Favery - Combining wheat and diverse perennial species: What is the impact on Z.tritici development and the wheat microbiome?
Lisa Besson , Sébastien Fontaine , Ga?l Alvarez , Thomas Bécu , Olivier Duchene , Audrey Niboyet , Nicolas Gross , Ga?lle Marliac - Accurate MAG reconstruction from complex soil microbiome through combined short- and HiFi long-reads metagenomics
Carole Belliardo , Nicolas Maurice , Arthur Pere , Samuel Mondy , Alain Franc , Marc Bailly-Bechet , Claire Lemaitre , Riccardo Vicedomini , Jean-Marc Frigerio , Franck Salin , ?lodie Belmonte , David James Sherman , Pierre Abad , Clémence Frioux , ?tienne G.J. Danchin - Représentant de l' institut INRAE - Construire un avenir soutenable
Charles Poncet - Présentation du programme de recherche du LIA WGB.
Cyrille Saintenac - Whole genome sequencing dataset for a Vitis vinifera diversity panel
Gautier Sarah , Baptiste Pierre , Eva Coindre , Agnès Doligez , Thierry Lacombe , Anne Mocoeur , Valérie Laucou , Catherine Roux , Sylvain Santoni , Elodie Belmonte , Vincent Pailler , Anthony Theron , Sandrine Dedet , Vanita Haurheeram , Christine Tollon-Cordet , Audrey Weber , Vincent Segura , Charles Poncet , Arnaud Bellec , Patrice This - Le projet AgriAURA2050
Jér?me Salse - Drought-Induced Epigenetic Memory in the cambium of Poplar Trees persists and primes future stress responses
Alexandre Duplan , Yu-Qi Feng , Gwenva?l Laskar , Bao-Dong Cai , Vincent Segura , Alain Delaunay , Isabelle Le Jan , Christian Daviaud , Anouar Toumi , Francoise Laurans , Mamadou Dia Sow , Odile Rogier , Patrick Poursat , Harold Duruflé , Véronique Jorge , Leopoldo Sanchez , Hervé Cochard , Isabel Allona , J?rg Tost , Régis Fichot - The "Agroecology & Markets" project led by the INRAE sector groups
Marie-Beno?t Magrini , Stéphane Bertagnoli , Jean-Luc Cadoré , Hugues Caillat , Frédérique Carlin , Philippe Debaeke , Luc Delaby , Fabrice Foucher , Bernadette Julier , Catherine Larzul , Laurence Lamothe , Bénédicte Lebret , Jacques Le Gouis , Valérie Lullien-Pellerin , Marie-Odile Nozieres-Petit , Sophie Prache , Michel Renard , Clementina Sebillotte , Catherine Schouler , Marc Tchamitchian
Production scientifique depuis 2021
- Polymère superabsorbant bioactif, son procédé de fabrication et ses utilisations - 2024